生物制藥凍干機對預凍速度的合理控制，可有效地縮短凍干的周期在制藥企業(yè)生產上具有明顯的經濟價值。
醫(yī)用制藥制品在凍干機中預凍有兩種方式：一種是制品與干燥箱同時降溫，另一種是待干燥箱擱板降溫至-40℃左右，再將制品放入，前者相當于慢凍，后者則介于速凍與慢凍之間，因而常被采用，以兼顧凍干效率與產品質量。此法的缺點是制品入箱時，空氣中的水蒸氣將迅速地凝結在擱板上，而在升華初期，若板升溫較快，由于大面積的升華將有可能超越冷凝器的正常負荷。此現象在夏季尤為顯著。經驗證明，過冷現象容易致使制品溫度雖已達到共晶點但溶質仍不結晶，為了克服過冷現象，制品凍結的溫度應低于共晶點以下一個范圍，并需保持一段時間，以待制品完全凍結。
冷凍速度的選擇：溶液速凍時(每分鐘降溫10~50℃)，晶粒保持在顯微鏡下可見的大小;相反慢凍時(1℃/分)，形成的結晶肉眼可見。粗晶在升華后留下較大的空隙，可以提高凍干的效率，細晶在升華后留下的間隙較小，使下層升華受阻。速凍的成品粒子細膩，外觀均勻，表面積大，多孔結構好，溶解速度快。
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